Jednou z primárnych prekážok liečby alebo vývoja účinnej vakcíny pre HIV je vysoká genetická diverzita samotného vírusu. Zatiaľ čo vírusy, ktoré používajú dvojvláknovú DNA na replikáciu, sú relatívne stabilné, retrovírusy ako HIV idú späť vo svojom replikačnom cykle (s použitím RNA s jedným kmeňom) a sú oveľa menej stabilné. V dôsledku toho je HIV veľmi náchylný k zmutovaniu mutácií, v skutočnosti asi o miliónkrát častejšie než bunky používajúce DNA.
Pri rozširovaní vírusovej genetickej rozmanitosti a pri prenose rôznych vírusových subtypov z človeka na človeka môže zmiešaný genetický materiál vytvárať nové hybridné jednotky HIV. Zatiaľ čo väčšina z týchto hybridu uhynie, málo prežívajúcich často vykazuje väčšiu odolnosť proti terapii HIV a v niektorých prípadoch rýchlejšiu progresiu ochorenia.
Variabilita HIV preto vytvára niečo "pohyblivého cieľa" pre výskumníkov s novými rekombinantnými (kombinovanými genetickými) druhmi schopnými odolávať alebo úplne vyhnúť sa neutralizačným látkam. Niektorí, podobne ako A3 / 02 kmeň identifikovaný švédskymi výskumníkmi v roku 2013, dokážu vyčerpať imunitnú obranyschopnosť osoby oveľa agresívnejšie než predtým známe kmene.
Čo sú HIV-1 a HIV-2?
Existujú dva typy HIV: HIV-1 a HIV-2. HIV-1 sa považuje za prevládajúci typ, ktorý predstavuje veľkú väčšinu infekcií na celom svete, zatiaľ čo HIV-2 je oveľa menej bežný a primárne sa sústreďuje v regiónoch západnej a strednej Afriky.
Zatiaľ čo obe tieto typy HIV môžu viesť k AIDS, HIV-2 je omnoho ťažšie prenosný a oveľa menej virulentný ako HIV-1.
V každom z týchto typov HIV existuje niekoľko skupín, podtypov ("clades") a podtypov. Nepochybne sa objavia ďalšie podtypy a rekombinantné kmene, pretože globálne šírenie HIV pokračuje.
HIV-1 skupiny a podtypy
HIV-1 je rozdelený do štyroch skupín: skupina M (čo znamená "major"); Skupina O (znamenajúca "odľahlosť", alebo za hranicami, kde sú viditeľné iné skupiny); a skupina N (znamená "non-M" a "non-O"); a skupina P (znamená "čakajúci"). Štyri rôzne skupiny sú klasifikované štyrmi rôznymi opičiemi vírusmi imunitnej nedostatočnosti (SIV), o ktorých je známe, že sa prenášajú z ľudoopov alebo šimpanzov.
HIV-1 Skupina M
Skupina M HIV-1 bola prvou identifikovanou skupinou a dnes predstavuje približne 90% prípadov HIV na celom svete a nachádza sa prakticky v každej časti planéty. V rámci tejto skupiny je 10 subtypov, ktoré môžu byť rozvrstvené okrem iného aj na ich geografické rozloženie a ich vplyv na rôzne rizikové skupiny.
- Podtyp A: videný v západnej Afrike a postihujúci primárne heterosexuálov a injekčných užívateľov drog (IDU).
- Podtyp B: prevládajúci podtyp v Európe, Amerike, Japonsku, Thajsku a Austrálii, čo predstavuje takmer všetky infekcie v Severnej Amerike a približne 80% všetkých v Európe. Infekcie sa vyskytujú viac u mužov, ktorí majú sex s mužmi (MSM) a IDU ako heterosexuáli.
- Podtyp C: opísaný ako najbežnejší podtyp HIV, ktorý predstavuje 48% všetkých infekcií na celom svete, predovšetkým heterosexuálov a predovšetkým v subsaharskej Afrike, Indii a častiach Číny.
- Podtyp D: Izolovať hlavne vo východnej a strednej Afrike.
- Podtyp E: subtyp videný iba v rekombinantnej forme s podtypom A.
- Podtyp F: medzi menším percentom infekcií pozorovaných v strednej Afrike, Južnej Amerike a Európe.
- Podtyp G: medzi menším percentom infekcií zaznamenaných v častiach Afriky a Európy.
- Podtyp H: medzi menším percentom infekcií zaznamenaných v strednej Afrike.
- Podtyp J: pozorovaný v severnej, strednej a západnej Afrike a v Karibiku
- Podtyp K: obmedzený na Konžskú demokratickú republiku (KDR) a Kamerun.
Skupina HIV-1 O
Skupina HIV-1 bola objavená v roku 1990 a predstavuje iba 1% infekcií na celom svete.
Táto skupina HIV je izolovaná v Kamerune av susedných afrických krajinách.
HIV-1 skupina N
HIV-1 skupina N bola objavená v roku 1998 a znova bola zaznamenaná iba v Kamerune s menej ako 20 dokumentovanými prípadmi.
HIV-1 skupina P
HIV-1 Skupina P je zriedkavý typ HIV, ktorý bol prvýkrát identifikovaný u ženy z Kamerunu v roku 2009. Môže sa líšiť od iných skupín HIV, keďže jeho pôvod je spojený s formou SIV nachádzajúcou sa v západných gorilí , Hoci klasifikácia "P" mala vyvodiť stav "čakajúci" (t. J. Očakáva sa potvrdenie ďalšej infekcie), druhý dokumentovaný prípad bol v roku 2011 identifikovaný u kamerunského muža.
HIV-2 skupiny
Aj keď boli HIV-2 identifikované inde, infekcie sú takmer výlučne pozorované v Afrike. V súčasnosti existuje osem skupín HIV-2, aj keď jediné podtypy A a B sú považované za epidémiu. Predpokladá sa, že HIV-2 prekonal druhy z druhu SIV, ktoré postihli opičí mangabeys opičia priamo na človeka.
Skupina A HIV-2 sa vyskytuje hlavne v západnej Afrike, hoci medzinárodné cesty viedli k malému počtu zdokumentovaných prípadov v USA, Európe, Brazílii a Indii. Naopak skupina HIV-2 bola obmedzená na časti západnej Afriky.
